Amuro Ray y su equipo de la nave White Base son enviados a una isla cerca de las Islas Canarias para eliminar a unos agentes de Zeon que siguen activos en la zona. A pesar de la aparente facilidad de la tarea, las cosas se complican cuando descubren que los agentes están trabajando en un nuevo proyecto secreto que podría cambiar las tornas de la guerra en su contra. La lucha por la supervivencia y la victoria se vuelve más intensa a medida que Amuro y sus compañeros luchan por cumplir su misión.