Yamada-kun to Lv999 no Koi wo Suru cuenta la historia sigue a Akane Kinoshita, quien, después de ser engañada por su novio en un juego, descubre que las relaciones amorosas en el mundo gamer pueden ser complicadas. En el juego, Akane conoce a Akito Yamada, un compañero de gremio poco sociable pero habilidoso en el juego. A pesar de que Yamada no parece tener interés en el amor, Akane se siente atraída por él y decide conquistarlo. Con la ayuda de nuevos amigos, Akane intenta ganarse el corazón de Yamada, quien tiene dificultades en asuntos amorosos, pero posee habilidades impresionantes en los juegos.